地暖锅炉水温设置需区分供暖与生活热水两种工况。对于地暖供暖回路，锅炉出水温度建议设置在45℃至55℃之间，具体视房屋保温、末端盘管间距及室外气温微调。若采用冷凝炉，最佳经济水温通常在50℃以下，可使烟气余热回收效率更高；常规壁挂炉则可设置在55℃左右，避免频繁启停。生活热水温度建议独立设定在42℃至45℃，冬季可略高至48℃，兼顾洗浴舒适与防烫安全。
地暖属于低温辐射采暖系统，与暖气片需要60℃至80℃高温水不同，地暖管材埋于混凝土蓄热层中，水温过高会加速管材老化、地面变形，并造成室内过热干燥。因此不建议将锅炉供暖水温长期调至60℃以上。若房屋保温较差或极寒天气下室温不足，可先检查分集水器各回路流量是否均衡，再以2℃至3℃为步进逐步上调锅炉出水温度，而非一次性大幅提高。
节能运行的关键在于降低回水温度并保持连续低温供暖。地暖系统热惯性大，频繁开关锅炉反而增加燃气消耗。建议白天家中无人时可将锅炉供暖水温下调至35℃至40℃维持基础温度，夜间或回家前再恢复至设定值，避免地面完全冷却后重新加热的高能耗。安装室内温控器或气候补偿功能后，锅炉可根据室外温度自动调节出水温度，进一步减少无效燃烧。
不同末端混装系统中，若地暖与暖气片共用一台锅炉，需通过混水中心将地暖侧水温控制在50℃以下，暖气片侧维持60℃以上，否则地暖管材存在安全隐患。地暖锅炉的最佳温度并非固定数值，而应结合房屋热负荷、保温等级、末端形式及使用习惯综合判断。通常以室内稳定达到18℃至22℃、锅炉回水温度不超过40℃为理想运行状态，此时系统热效率最高，燃气费用与设备寿命均处于较优平衡点。