锅炉补贴款的申领部门，需结合补贴类型、属地管理原则确定，不同场景下对应的负责部门存在差异。
若是工业锅炉节能改造、超低排放改造类补贴，通常由属地生态环境部门牵头负责，部分地区会联合发改、工信部门共同审核。这类补贴多针对燃煤锅炉超低排放改造、生物质锅炉提标改造、工业锅炉能效提升等项目，企业需先向属地生态环境局污防科或大气科提交申请材料，包括改造方案、设备参数、验收报告等，经现场核查、资料审核通过后，再由财政部门拨付补贴资金。
若是民用清洁取暖锅炉补贴，比如农村地区清洁取暖煤改电、煤改气涉及的锅炉购置或改造补贴，主要由属地住房和城乡建设部门负责，部分地区由农业农村部门或乡镇（街道）便民服务中心承接申报。居民可携带身份证、房产证明、购置凭证等材料，到户籍或居住地所在的乡镇（街道）对应窗口提交申请，经村级公示、乡镇审核、县级部门复核后，补贴资金会直接拨付至申请人个人账户。
若是特种设备范畴内的锅炉相关政策性补贴，部分地区会由市场监督管理部门特种设备安全监察机构参与审核，主要核实锅炉的合规性、检验合格证明等材料，确保补贴发放对象符合特种设备管理要求。
需要注意的是，各地补贴政策的牵头部门可能存在细微差异，建议申报前先通过属地政务服务网查询对应补贴项目的实施细则，或拨打12345政务服务便民热线咨询具体负责部门，避免跑错窗口耽误申报进度。同时，申请补贴时需确保提交的材料真实有效，锅炉改造需符合国家及地方的能效、环保标准，否则可能无法通过审核。