锅炉热效率是指锅炉有效利用热量与输入锅炉总热量的比值，是衡量锅炉能源利用效率的核心性能指标，直接关系到锅炉的运行成本与节能效果。不同类型、不同燃料的锅炉，热效率存在较为明显的差异。
常规燃煤锅炉的热效率相对偏低，传统层燃式燃煤锅炉的热效率一般在60%-80%之间，受煤炭品质、燃烧方式、炉体密封性能等因素影响较大，部分老旧小型燃煤锅炉热效率甚至可能低于60%。随着环保节能技术升级，新型循环流化床燃煤锅炉通过优化燃烧结构、配套余热回收装置，热效率可提升至85%-90%左右。
燃油燃气锅炉是目前应用较为广泛的清洁燃料锅炉，其燃烧充分、燃料利用率高，常规卧式燃油燃气锅炉的热效率通常在90%-95%之间。搭配冷凝式余热回收技术的冷凝式燃气锅炉，可回收烟气中的汽化潜热，热效率最高可突破100%（按低位热值计算时），常规冷凝锅炉热效率普遍在95%-108%区间。
生物质锅炉以生物质颗粒、秸秆等为燃料，受燃料热值、燃烧特性影响，热效率略低于燃气锅炉，常规生物质蒸汽锅炉、热水锅炉的热效率一般在80%-90%之间，采用分层燃烧、二次风配风技术的高效生物质锅炉，热效率可达到90%以上。
电锅炉是将电能直接转化为热能的锅炉设备，能量转换过程中几乎无燃烧损耗与排烟热损失，热效率普遍较高，常规电阻式电锅炉热效率在95%-98%左右，电磁式电锅炉热效率可达到98%以上。
锅炉实际运行热效率还会受负荷率、水质情况、日常维护水平等因素影响，保持锅炉在额定负荷70%-100%区间运行、定期清理水垢与积灰，能有效保障锅炉处于高效运行状态。