锅炉环保检查标准主要围绕大气污染物排放、运行环保管控两大维度设定，不同使用场景、燃料类型的锅炉执行对应分级管控要求，是保障锅炉合规运行、防控污染排放的核心依据。
大气污染物排放是检查的核心指标，其中颗粒物、二氧化硫、氮氧化物为必查的三项常规污染物，不同区域、不同容量的锅炉执行的限值有所差异：重点管控区域内的燃煤锅炉，颗粒物排放限值通常不超过10mg/m³，二氧化硫不超过35mg/m³，氮氧化物不超过50mg/m³；一般区域的燃煤工业锅炉，对应限值会适当放宽，燃气锅炉的污染物排放限值整体低于燃煤锅炉，部分低氮燃烧改造后的燃气锅炉，氮氧化物排放可控制在30mg/m³以内。除此之外，烟气黑度、汞及其化合物等也是部分专项检查的补充指标。
除了排放浓度，检查还会覆盖锅炉配套环保设施的运行情况：包括脱硫、脱硝、除尘设备的投运率、运行参数是否达标，在线监测设备是否正常联网、数据是否准确可追溯，燃料进场的品质检测记录是否完整，燃煤锅炉的煤质含硫量、灰分是否符合管控要求，燃气锅炉的气源品质是否达标。
不同用途的锅炉检查侧重点略有不同，工业生产锅炉侧重长期稳定达标排放，民用采暖锅炉侧重重污染天气应急减排措施的落实，生物质锅炉则会额外检查是否存在违规掺烧化石燃料的情况。具体执行标准需结合项目所在区域的生态环境管控要求、锅炉的额定蒸发量或热功率、燃料类型等因素确定，所有在用锅炉均需满足对应时段的环保管控要求，否则将面临整改或处罚。