6吨蒸汽锅炉的热效率并非固定数值，而是受锅炉类型、燃料种类、运行工况、设备维护水平等多重因素影响，不同品类的6吨蒸汽锅炉热效率存在明显差异。
目前市场主流的6吨燃气蒸汽锅炉，是热效率表现较优的品类之一。采用全预混燃烧、冷凝回收技术的燃气蒸汽锅炉，排烟温度可降至50℃-60℃，能充分回收烟气中的显热与水蒸气潜热，热效率通常可达95%-108%。这里的效率值超过100%，是因为计算时将低位发热量基准下的潜热回收纳入统计，属于行业内对冷凝锅炉效率的常规表述方式。
6吨生物质蒸汽锅炉的热效率相对略低，通常在82%-90%之间。受生物质燃料热值波动、灰分含量较高等特性影响，燃烧过程中易出现结渣、不完全燃烧等问题，会一定程度拉低热效率。若采用分层给料、二次风配风等优化技术，配合规范的燃料筛分与配比，热效率可接近90%上限。
6吨燃煤蒸汽锅炉的热效率跨度较大，普通链条炉排燃煤锅炉热效率多在75%-85%之间，而采用循环流化床技术的燃煤锅炉，因燃料燃烧更充分，热效率可提升至88%-92%。但随着环保要求趋严，燃煤蒸汽锅炉的应用场景已受到较多限制。
此外，锅炉的实际运行热效率还与负荷匹配度密切相关。当6吨蒸汽锅炉在70%-100%额定负荷区间运行时，热效率处于较高水平；若长期处于低负荷运行状态，燃烧稳定性下降，热效率会出现5%-10%的降幅。定期进行锅炉清灰、水垢清理、燃烧器调试等维护工作，也是保障热效率稳定在合理区间的关键。