WNS热水锅炉在长期运行过程中，受水质硬度、补水方式及运行温度等因素影响，水侧受热面极易形成以碳酸钙、硫酸钙为主的水垢。水垢导热系数仅为钢材的几十分之一，一旦结生，不仅降低热效率、增加燃料消耗，还可能导致炉管局部过热鼓包甚至爆管。因此，针对WNS热水锅炉内结垢问题，需根据垢层厚度与成分，采取科学合理的处理措施。
对于轻微结垢或运行中预防性处理，常采用化学清洗法。选用对碳钢腐蚀率低的有机酸清洗剂，如氨基磺酸、柠檬酸或专用锅炉除垢剂，按垢量计算药剂浓度，配合缓蚀剂和渗透剂，在50至60摄氏度条件下循环清洗6至10小时。清洗过程中应每隔1小时检测清洗液pH值和铁离子浓度，防止酸液过度腐蚀金属基体。清洗结束后，立即用清水反复冲洗，并加入中和钝化剂，使金属表面形成保护膜。
若结垢较厚或垢层坚硬，单纯化学清洗难以彻底去除，可采用机械与化学联合方式。先利用软轴洗管器或高压水射流对炉胆、烟管等主要受热面进行物理除垢，将大部分疏松垢层剥离，再进行化学清洗以溶解残余硬垢。机械清理时需控制水压不超过60兆帕，避免损伤管壁。
对于已发生严重结垢并伴随局部过热变形的锅炉，应首先停炉自然冷却，检查受压元件有无裂纹、鼓包等缺陷。确认无损伤后，再实施除垢。除垢完成后，应进行水压试验，试验压力按原设计压力的1.25倍执行，保压20分钟无渗漏为合格。
除垢后的水质管理同样关键。WNS热水锅炉应配套安装软化水设备或加药装置，将给水硬度控制在0.03毫摩尔每升以下，锅水pH值维持在10至12之间，并定期排污。建议每半年取水样化验一次，根据水质报告调整排污量和加药量，从源头减少水垢生成，延长锅炉使用寿命。