厂区锅炉的管辖归属需结合锅炉的使用属性、压力等级及监管场景确定，核心监管主体为各地市场监督管理部门，同时需配合多部门协同管理。
市场监督管理部门是厂区锅炉的主要管辖单位，负责锅炉从设计、制造、安装、使用到报废全生命周期的安全监察。厂区内承压蒸汽锅炉、承压热水锅炉、有机热载体锅炉等特种设备类锅炉，均需在市场监管部门办理使用登记，定期接受法定检验机构的安全性能检测，操作人员需持有特种设备作业人员证方可上岗。若锅炉存在安全隐患或违规使用情况，市场监管部门有权责令整改、查封设备甚至作出行政处罚。
若厂区锅炉涉及能源消耗与节能管理，由各地发展和改革部门及工业和信息化部门依据节能法规管辖，负责监督锅炉能效指标达标情况，推广高效节能锅炉技术，对落后低效锅炉实施淘汰管理。
当厂区锅炉配套燃烧系统涉及废气排放时，生态环境部门负责管辖其污染物排放达标情况，要求锅炉安装废气处理设施，落实排污许可制度，对超标排放行为依法查处。
部分厂区内由企业自主管理的非承压热水锅炉、常压热水锅炉，虽不属于特种设备监管范畴，但仍需符合消防安全及安全生产相关要求，由属地应急管理部门及消防救援机构按职责进行监督指导。
明确厂区锅炉的管辖部门，有助于企业依规办理相关手续，落实安全主体责任，避免因管辖归属不清导致合规风险。