高效锅炉的效率并没有统一固定值，而是根据锅炉的燃料类型、结构设计、运行工况等因素存在明显差异，目前行业内公认的高效锅炉，热效率普遍能达到90%以上，部分先进机型甚至能突破100%。
从燃料类型来看，燃气高效锅炉是当前市场应用最广的品类，普通燃气锅炉热效率多在85%-90%区间，而采用冷凝技术的高效燃气锅炉，通过回收烟气中的显热和水蒸气凝结释放的潜热，热效率可达到95%-108%，这也是唯一能实现热效率“超100%”的锅炉类型——其效率计算基于低位发热量，潜热回收相当于额外利用了燃料中未被计入低位热值的能量。
燃煤高效锅炉的效率相对偏低，传统燃煤锅炉效率多在60%-80%，而采用循环流化床、煤粉燃烧等先进技术的高效燃煤锅炉，配合分级燃烧、余热回收等装置，热效率可提升至85%-92%，同时能大幅降低污染物排放，符合环保要求下的高效运行标准。
生物质高效锅炉作为清洁能源锅炉的一类，普通生物质锅炉效率约70%-80%，采用气化燃烧、余热回收优化的高效生物质锅炉，热效率可达85%-90%，能稳定适配各类工业生产、集中供暖场景的供热需求。
需要注意的是，锅炉的实际运行效率还受负荷率、水质情况、维护保养等因素影响，比如长期低负荷运行、水垢堆积、密封不严等问题，都会导致高效锅炉的实际效率下降10%-20%。因此，要保障锅炉长期处于高效运行状态，除了选择高效率的机型，还需规范运行操作、定期维护检修。