工厂锅炉房的管辖归属需结合设备属性、运行场景及监管要求划分，涉及多个职能部门的协同管理，并非单一主体全权负责。
从特种设备监管维度看，工厂内承压类锅炉房（含蒸汽锅炉、承压热水锅炉等）主要由市场监督管理部门管辖。依据《特种设备安全法》《锅炉安全技术规程》等法规要求，市场监管部门负责锅炉的设计、制造、安装、改造、修理、使用、检验检测全链条安全监察，包括锅炉使用登记办理、作业人员资质核查、定期检验监督、安全隐患排查及违法违规行为查处等，是锅炉房安全监管的核心主体。
从生态环境监管维度看，工厂锅炉房的环保达标情况由生态环境部门管辖。针对燃煤、燃气、燃油等燃料类型的锅炉，生态环境部门负责监管烟气排放浓度（如颗粒物、二氧化硫、氮氧化物等指标）是否符合国家及地方大气污染物排放标准，同时对锅炉的环保设施运行、超低排放改造、污染物排放监测等工作进行监督检查，对超标排放等环境违法行为依法处置。
从安全生产综合监管维度看，应急管理部门对工厂锅炉房的安全生产工作实施综合监督管理。若锅炉房涉及危险化学品储存（如燃油锅炉的储油设施、燃气锅炉的燃气调压装置），应急管理部门还需依据危险化学品安全管理相关规定开展监管，督促工厂落实安全生产主体责任，建立健全锅炉房安全管理制度、操作规程及应急处置预案。
此外，工厂锅炉房的日常运行管理由工厂自身负责，需配备持证作业人员，落实日常巡检、维护保养、隐患整改等工作，主动配合各监管部门的监督检查。部分园区内的工厂锅炉房，还需接受园区管委会相关职能机构的属地化管理，确保各项监管要求落地执行。